Magneții supraconductori sunt realizați prin utilizarea fenomenului că rezistența materialelor supraconductoare scade la zero la o anumită temperatură. Ele sunt de obicei realizate din material din aliaj de niobiu-titan și răcite cu heliu lichid (4,2K). Când curentul trece prin bobina magnetică, după câmpul magnetic, deconectați sursa de alimentare pentru a forma un câmp magnetic stabil și uniform. Magnetul menține bobina sub temperatura critică prin agentul frigorific și nu este nevoie de alimentare suplimentară.

Magneții supraconductori pot produce o putere mai mare a câmpului magnetic, o stabilitate mai bună a câmpului magnetic și o uniformitate a câmpului magnetic. Aceasta înseamnă o calitate mai bună a imaginii, un raport semnal-zgomot, contrast și rezoluție mai bun și o viteză mai mare a imaginii.

Magneții supraconductori convenționali au, în general, o structură în formă de butoi, care este predispusă la potențiala „claustrofobie” și nu este propice pentru operarea și observarea de către medici a semnelor animalelor de companie sub anestezie. În plus, deoarece magnetul supraconductor convențional are un câmp magnetic mai mare, este necesară o zonă mai mare de instalare a dispozitivului.